股东持股比例通常是根据股东各自的出资额占公司注册资本的比例来计算的。具体的计算公式如下：
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股东持股比例 = （股东出资额 ÷ 注册资本金） × 100%
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举个例子，如果一个公司的注册资本金为90万元，某股东出资10万元，则该股东的持股比例计算如下：
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股东持股比例 = （10万元 ÷ （90万元 + 10万元）） × 100% = 10%
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这意味着该股东持有公司10%的股份。年底的分红等权益分配也通常按照这个比例进行。需要注意的是，这个比例可能会因为新股发行、股份回购、股东之间的股权转让等原因发生变化，需要重新计算。