员工停薪留职期间，社保的处理方式通常由劳资双方协商确定。以下是几种常见的处理方式：
协议约定
如果双方有明确的协议，约定在停薪留职期间保险由个人交纳，则单位可以据此停交保险。
如果协议中未明确约定，单位可能继续承担法律规定承担的部分社保费用。
法律规定
根据《中华人民共和国社会保险法》，单位有义务为员工缴纳社会保险费。
如果员工在停薪留职期间从事其他有收入的劳动，原则上应按月向原单位缴纳一定比例的劳动保险基金。
地方规定
不同地区可能有不同的规定，例如北京市规定，请长假保留劳动关系但不支付工资的人员，企业应与其签订书面协议，并按规定缴纳社会保险费。
实际操作
员工在停薪留职期间，如果找到新单位，可以将养老保险转移到新单位。
办理转移时，参保人员需向新参保地社保经办机构提出转移申请，并提供相关信息。
注意事项
停薪留职期间，员工应继续缴纳待业保险基金、养老保险基金及其他费用，以保持连续工龄。
如果未经企业批准就擅自离职，企业可能会按违反劳动纪律处理。
建议在停薪留职前，员工应与用人单位就社保缴纳的问题达成一致，以免影响相关社保待遇的享受。如果双方无法协商一致，可以咨询当地劳动和社会保障部门或法律专业人士获取帮助