办理乡镇房屋的房产证通常需要遵循以下流程：
申请条件
申请人需为本乡居民，且只有一处住宅。
户籍所在村为中心村（屯），并确实需要建房。
提交材料
申请人身份证明（身份证、户口本）。
宅基地使用权证明或集体所有建设用地使用权证明。
房屋符合城乡规划的证明。
房屋测绘报告或村民住房平面图。
其他必要材料。
办理程序
向村委会提出建房申请，并经过村委会审核同意，签字盖章。
向乡建办（乡镇建设办公室）提出申请，乡建办工作人员会实地踏看并同意建房。
领取房屋建设申请表，经乡建办签字同意，并由乡主管领导签字盖章，核实同意。
提交县规划建设局（县行政服务中心）审批。
审批通过后领取产权证。
法律依据
根据《民法典》第二百零九条，不动产物权的设立、变更、转让和消灭，需依法登记后发生效力。
注意事项
在房屋建好后，依据产权证向房管部门申请办理房产证。
办理过程中可能需要缴纳相关税费，如契税、公共维修基金、印花税等。
请根据当地具体规定和流程操作，因为不同地区可能存在细微差别。