在南京办理护照的流程如下：
准备材料
本人身份证或者户口簿。
填写《中国公民因私出国申请审批表》并填写申请表。
提交申请时必须携带下列材料：
本人身份证或者户口簿原件和户口簿首页、本人资料页、变更页及身份证的复印件。
符合要求的彩色照片一张。
选择办理地点
可以选择前往南京市公安局出入境办证大厅或雨花台、栖霞、建邺、秦淮、鼓楼、玄武、雨花、江宁、浦口、六合、溧水、高淳等区公安出入境办证大厅申请。
办理流程
携带上述材料前往选定的出入境管理部门。
填写护照申请表，提交申请并等待审批。审批、制作和签发护照的时间是14个工作日。
领取护照时，须携带本人身份证或者户口簿及200元工本费。
注意事项
未满16周岁的儿童须由父母或父母委托的监护人代为申请，并提交相关监护关系材料。
申请人须在受理当日交费，未按时限交费将视为自动放弃申请。
建议提前准备好所有材料，并选择合适的时间前往办理地点，以确保流程顺利进行。