商检证书的办理流程如下：
接受报验
对外贸易关系人向商检机构报请检验，填写报验申请单，明确申请检验、鉴定工作项目和要求，并提交相关单证和资料，如外贸合同、信用证、厂检结果单正本等。
抽样
商检机构接受报验后，会及时派员赴货物堆存地点进行现场检验、鉴定。抽样过程中，需按照规定的方法和一定的比例，在货物的不同部位抽取能代表全批货物质量的样品供检验之用。
检验
商检机构会仔细审核合同（信用证）对品质、规格、包装的规定，然后利用各种技术手段对样品进行检验，如感官检验、化学分析、仪器分析等。检验形式可以包括商检自验、共同检验、驻厂检验和产地检验。
签发证书
如果商品检验合格，商检机构会签发检验证书或在“出口货物报关单”上加盖放行章。出口企业在取得检验证书或放行通知单后，即可在规定的有效期内报运出口。若检验不合格，出口商应及时向商检机构申请复验并出证，以便向相关方提出索赔。
建议：
办理商检证书时，应提前准备好所有必要的单证和资料，确保资料的真实性和完整性。
选择专业的代理报检公司可以简化流程，提高效率。
对于特殊商品如危险品，需要遵循更严格的报检流程，并及时与商检机构沟通以确保顺利通过检验。