皮鞋鞋底掉色可以采取以下几种方法处理：
使用鞋油或颜料补色
可以使用鞋油或其他一些能够给皮鞋上色的颜料进行补色。如果掉色太厉害，可以考虑给皮鞋换皮革或者到专门的修鞋机构进行补救。
白蜡涂鞋内里
通常情况下皮鞋都是用水染皮料做鞋里、鞋垫，穿着时由于脚部出汗或鞋进水，都会出现脱色情形。可用白蜡涂于鞋子里面，用吹风机的暖风吹上半分钟左右，以后皮鞋里面就不会掉色了。
鸡蛋清涂鞋里
对于里面掉色的皮鞋，可用鸡蛋清涂上薄薄的一层，然后将鞋子置于干燥通风处24小时以上，再穿的时候里面就不会掉色了。鸡蛋清对于鞋子磨脚的情况也适用。
专业皮具保养店
皮鞋鞋底小面积掉色一般情况下是不影响穿着的，可以不用管。但如果掉色非常严重，坐着或翘起腿的时候都已经明显的能看到大面积的掉色了，就要去专业修鞋店，换一个新鞋底。
使用专用溶液
皮具保养店有一种专用的溶液可以专门解决皮鞋里面掉色的问题。将皮鞋拿到皮具保养店，告诉他们你所遇到的情况与问题，大多数的皮具保养店都能提供这样的服务。
日常护理
在购买新皮鞋时，可以提前用湿布擦拭鞋面，让皮鞋上的染料固色。在穿着过程中，尽量避免让皮鞋接触水或潮湿环境，减少掉色几率。可以选择专业的皮鞋护理产品，如鞋油或护理喷雾，按照说明书进行定期护理。
避免阳光直射
皮鞋掉色后，应避免将湿鞋放在太阳下暴晒，否则会出现爆裂或收缩现象。应将湿鞋放在阴凉处自然风干。
通过以上方法，可以有效地解决皮鞋鞋底掉色的问题。如果掉色严重，建议到专业修鞋店进行更换鞋底的处理。