办理厦门健康证的流程如下：
预约体检
通过拨打96166、关注“美丽厦门智慧健康”公众号、医院公众号或直接到现场进行预约。
集体预约请拨打指定免费医疗机构的咨询电话。
从业人员只能在用工单位所在区的定点医疗机构进行体检，不支持跨区体检。
体检
按预约时间携带身份证原件和相关材料前往预约的医疗机构。
领取体检表并到收费处缴纳体检费。
进行检验室采血、大便肛拭化验。
进行内科、外科常规体检。
进行X光胸透。
培训
体检合格后，参加由卫生监督机构组织的卫生法律法规知识培训。
培训合格后，可领取“卫生法规知识培训合格证”，此证有效期两年。
领取健康证
体检和培训都合格后，可在四个工作日后凭体检收费发票或体检凭证领取《健康证明》。
厦门已全面推行电子健康证，体检完成5个工作日后，可在电脑或手机上查询电子健康证信息。
请注意，体检和培训的详细地址、时间和费用可能会有所变动，建议提前通过官方渠道确认最新信息。