台湾护照的申请流程如下：
准备材料
填写完整并贴有申请人相片的《大陆居民往来台湾地区申请审批表》，首次申请须另外提交相同规格的相片2张。
交验申请人居民身份证、户口簿原件，提交复印件，申请人未满16周岁只需提交户口簿。
提交具有经营赴台旅游资质的组团旅行社出具的团队旅游办证名单表。
旅游团领队申办证件及签注由其所在的组团社统一向组团社所在地公安机关出入境管理部门提出申请，并交验组团社出具的公函及赴台旅游领队证。异地申请的，由审批机关发函户口所在地公安机关核查相关情况后予以办理。
登记报备的国家工作人员须按照组织、人事管理权限履行审批手续后提交申请。
持证人遗失证件，向原受理申请的直辖市、地（市）级公安机关出入境管理部门申请补发，提交证件报失地警察机关出具的证明。
证件有效期不足6个月或所申请签注有效期超过证件有效期的，证件内页用完，证件损毁的须申请换发，提交原《大陆居民往来台湾地区通行证》，证件损毁的，提交证件损毁说明书。
由本人到出入境管理部门提交申请，但申请人未满16周岁的由监护人陪同办理或代办，提交监护人身份证原件、复印件及能证明监护关系的相应资料；申请人年满70周岁可以委托直系亲属或其他监护人代办，须提交委托书、代办人身份证原件、复印件。
申请人另需按组团旅游社要求提供相应资料办理“入台许可”。
填写申请表
携带上述材料去户籍所在地的公安局出入境管理处填写《中国公民因私出国申请审批表》，复印相关证明材料，拍照照相（须穿深色衣服）。
递交申请
将填写好的贴好照片的申请表格和所需材料递交到受理窗口，待工作人员审核完毕后，领取《因私出国（境）证件申请回执》单，核对回执单内容确认无误后签名。
缴费
申请人在递交完申请后须立即持《因私出国（境）证件申请回执》到收费处交费（申请人须在受理当日交费。未按时限交费，领取证件日期将另行通知）。若申请后一个月内未交费，视为自动放弃申请，申请材料不再退还本人）。
领取护照
本人领取：申请人本人须按照《因私出国（境）证件申请回执》上注明的取证日期或出入境管理部门通知的取证日期按时领取证件。
建议提前准备好所有必需的材料，并按时前往公安机关出入境管理部门办理，以确保流程顺利进行。