菌体蛋白，也称为微生物蛋白或单细胞蛋白，是指 存在于真菌或细菌细胞内的一类蛋白质。这些蛋白质是这些微生物生命活动的重要组成部分，并且具有多样的结构和功能。根据生产原料的不同，菌体蛋白可以分为石油蛋白、甲醇蛋白、甲烷蛋白等；根据产生菌的种类不同，又可以分为细菌蛋白、真菌蛋白等。1967年在第一次全世界单细胞蛋白会议上，将微生物菌体蛋白统称为单细胞蛋白。
菌体蛋白的营养价值丰富，蛋白质含量高达40%~80%，比大豆高10%~20%，比肉、鱼、奶酪高20%以上。此外，菌体蛋白还可以作为饲料使用，有效物质含量中粗蛋白质含量高达75%，苏氨酸含量为29.8%。
单细胞蛋白是通过人工培养含有高蛋白的微生物菌体而获得的，它不是一种纯蛋白质，而是由蛋白质、脂肪、碳水化合物、核酸及非蛋白质的含氮化合物、维生素和无机化合物等混合物组成的细胞质团。
综上所述，菌体蛋白是一种重要的蛋白质来源，广泛应用于食品、饲料、医药等领域。