肽藻的养殖主要包括以下几个步骤：
藻种培养
培养容器：可以使用不同大小的三角烧瓶，容量有100、300、500、1000毫升等，适用于逐渐扩大培养。
灭菌：培养容器和工具需经煮沸灭菌或使用化学药品灭菌后，用煮沸水冲洗。培养液用加热灭菌法灭菌。
接种：按种后瓶口用灭菌纸包扎，放在适宜的光照和温度条件下培养，每天轻轻摇动二次。大约二周后进行一次移植。
检查与保藏：在培养过程中必须定期用显微镜检查，保持不受其他生物污染。藻种可以保存在固体培养基上，在常温、弱光下保藏半年到一年；也可在低温下（冰箱内）保藏，每天接受短时间（几个小时）弱光，可保藏2~3年。
水体处理与接种
清塘、消毒、解毒：首先对养殖的水体进行清塘、消毒、解毒，以消除有害微生物和有害物质。
接种有益藻类：根据季节选择不同的藻种进行培养。例如，低温季节可以选择硅藻类小环藻等，温度升高到20度左右可以选择小球藻或其他绿藻。
营养缓冲系统的建立
使用氨基酸培藻膏：每亩用含肽等需要微生物帮助才能够分解提供藻吸收利用营养素的水溶性“氨基酸培藻膏”，让水体具有一定的营养缓冲能力，使藻有持续的营养供应。
浸出肥水膏：用浸出肥水膏1-2公斤全池泼洒，让藻在几个小时内繁殖起来，避免阳光晒到池底长出青苔。
通过以上步骤，可以有效地进行肽藻的养殖。在整个养殖过程中，保持水质的稳定和适宜的环境条件是至关重要的。定期检查藻类的生长情况，及时进行移植和营养补充，可以有效提高养殖的成功率。