办理农村自建房房产证通常需要遵循以下流程和准备相应的材料：
办理流程：
申请
向村委会提出建房申请。
村委会审核同意并签字盖章。
提交材料
向乡建办提交申请，并提供必要的材料，如身份证明、建房申请等。
领取房屋建设申请表，并经过乡建办签字同意。
审批
乡主管领导签字盖章，核实同意。
提交县规划建设局审批。
缴费
根据当地规定缴纳相关费用。
登记
经审核无异议后，将申请登记事项记载于不动产登记簿。
发证
核发不动产权证。
所需材料：
1. 申请人身份证明。
2. 宅基地使用权证明或集体所有建设用地使用权证明。
3. 房屋符合城乡规划的证明。
4. 房屋测绘报告或村民住房平面图。
5. 其他必要材料，如村委会或乡建办的相关审核文件。
注意事项：
申请人需为本集体经济组织的成员，并符合宅基地申请条件。
办理过程中可能需要公告，以确认无异议。
办理费用可能因地区而异，具体可咨询当地房管部门。
请根据当地的具体规定和流程进行操作，因为不同地区可能有细微差别。