办理水产养殖公司的审批流程如下：
核准名称
确定公司类型、名字、注册资本、股东及出资比例。
到工商局现场或线上提交核名申请。
核名通过后，会收到准予设立登记通知书。
提交资料
携带准予设立登记通知书和办理人身份证原件到工商局。
提交包括个人或单位的身份证明、经营场所证明、养殖设备状况证明等。
提交其他可能需要的材料，如商业计划书、产品销售渠道及市场调查报告等。
审核与领证
渔业部门或工商局对提交的材料进行审核，核实申请人或单位的资格和条件是否符合要求。
审核通过后，申请人或单位可以领取水产营业执照的申请表。
缴纳相关费用后，渔业部门或工商局会发放水产营业执照。
刻公章
领取营业执照后，需要到特定派出所刻公章，包括公司章、财务专用章、私章、发票章等。
开立基本账户
到开立验资户的银行或其他银行开设公司基本账户。
税种核定
拿到营业执照后，尽快到税务报到，拿税务登记证，未进行税务登记的公司可能会受到处罚。
其他许可
根据养殖项目的具体情况，可能还需要办理其他相关许可，如养殖证、土地养殖设施用地证明、动检证等。
建议在办理过程中，确保所有材料的真实性和完整性，并提前了解当地工商和税务部门的具体要求和流程，以确保审批过程顺利进行。