申请农田用于水产养殖需要遵循以下步骤：
登记备案
在开始养殖前，需要到当地农村土地承包经营权所在地的乡镇（街道）农业委员会申请登记备案。
土地流转
如果是农村集体土地，则需要经过土地承包经营权流转手续，与土地所有者签订土地承包合同和协议。
申请环评
如果养鱼池的规模较大，需向环境保护部门申请环境影响评价。
办理相关手续
在办理土地承包使用权、申请环评等手续后，需要向相关部门办理水务、环保手续。根据情况，还需要办理相关质量认证、卫生许可等相关手续。
申请养殖证
养殖鱼池需要办理相应的养殖证。需向当地农业部门申请种苗证、动物防疫证和养殖证等。
提交申请
向需要征用的农田所在村的村委提交正式的书面申请，申请书经由当地的村、乡镇同意，正式提交相关材料报土地利用规划部门审批。
审批程序
提交申请材料后，需要根据当地的审批程序进行审批，审批程序一般包括初审、公示、听证、批准等环节。
签订合同
在获得用地审批批准后，需要与土地管理部门签订土地使用合同，并办理相关手续，如缴纳土地使用权出让金等。
遵守规定
在建设养殖场时，一定要办理动物防疫条件合格证和排污许可证。养殖证是国家要求海域水产养殖和内陆水域养殖户需要办理的证件。
其他手续
根据具体情况，可能还需要办理农业用地转建设用地的审批手续，以及相关的工商登记等。
以上步骤仅供参考，具体申请流程和所需材料可能因各地要求而有所不同，建议咨询当地相关部门获取详细信息。