养殖的鸡的清理主要包括以下几个方面：
鸡舍清理
清洁鸡舍是防止疾病爆发的有效措施。清洁顺序应先上到下，先里后外，确保全面覆盖。
重点冲洗区域包括顶棚、笼架、料槽、粪板、进风口、墙壁、地面、储料间、休息室、操作间和粪沟等角落，避免形成死角。
冲洗废水需通过鸡舍后面排出室外，并及时清理或处理，防止污染场区和禽舍环境。
清洁完毕后，要对工作效果进行检查，确保无残留饲料、鸡粪及鸡毛等污物。对于清洗不合格的部位，应立即重新冲洗，直到符合要求。
设备清洁
对于不可移动的设备，应先用水浸泡，然后彻底清洗并使其干燥。高压水龙头能有效清洗设备，清洗不到的地方如饮水管与笼具接触处、线槽、料槽、电机、风机等需要特别注意擦洗。
清洗设备后，所有电器设备应断开开关，使用高压水枪简单冲刷，并迅速排净剩余水分，防止残留消毒药剂对家禽健康造成影响。
粪便和杂物清理
家禽出栏后，应及时清理栏舍内的粪便和杂物，并进行地面与墙壁的清洗，使饲养环境更加干净。
清理过程中，所有灰尘、碎屑和蜘蛛网必须从鸡舍内各处的凸处墙角上清扫掉，最好用扫帚扫掉或吹风机吹。
粪场里的粪便和垫料应在冲刷前全部处理掉，避免污染场区。
消毒工作
清洁、干燥后的鸡舍需要用石灰水等进行全面的消毒工作，保证栏舍干净与整洁。消毒后需空置15天左右，确保残留的消毒药剂不会对家禽健康造成影响。
如果上一批家禽出现了传染病，还需要用福尔马林等具有强杀菌效果的消毒剂进行消毒，待味道散尽后才可以进雏。
通过以上步骤，可以有效地清理养殖的鸡及其饲养环境，确保鸡舍和设备干净整洁，从而降低疾病发生的风险。