石材厂房屋顶防水的施工方法如下：
基层处理
清除原有防水层和杂物，确保基层平整、干燥、无裂缝。
对于管根、阴阳角等易发生渗漏的部位，应进行特别处理，如做成圆弧角或钝角，并铺设附加层。
找平层施工
使用水泥砂浆或豆石混凝土进行找平，确保地面和墙面交接处抹小圆角或坡角，表面平整无浮灰。
防水层施工
建议使用水泥基防水材料，横竖各刷一遍，管根和墙角处先刷，常温4小时后表干，再大面积涂刷，避免漏刷和鼓泡。
先涂刷立面后涂刷平面，下一遍涂刷方向与上一遍垂直。
地面防水层应涂刷出卫生间门口以外300宽，门口位置预先用水泥砂浆做一道高出地面大约20mm的小坎，防止水往客厅方向渗透。四周墙面防水层高度不低于300mm，有淋浴的卫生间墙面防水层应高出地面1800mm。
特殊部位处理
管根周围应清理干净，无杂物和油污，采用密封材料填充缝隙，并铺设附加层，宽度大于30cm，使用与防水层相同或相容的材料。
天沟和檐沟应清理干净，检查排水是否顺畅，无积水现象，然后涂刷防水涂料或铺设防水卷材，确保卷材与基层粘结牢固，无空鼓和翘边。
闭水试验
防水施工完成后，进行24小时的闭水试验，检查是否有渗漏现象。
保护层施工
防水层施工完毕后，应在其表面做一层砂浆保护层，厚度约1.5mm，分两次施工，最后洒水养护。
通过以上步骤，可以有效地对石材厂房屋顶进行防水处理，确保建筑物免受雨水侵蚀，延长使用寿命。建议在施工过程中严格按照上述步骤操作，并在每个环节进行检查，确保防水层的质量和效果。