截至2024年，分子科学与工程专业大学排名如下：
北京大学（A+）
清华大学（A+）
中国科学技术大学（A+）
南开大学（A）
天津大学（A）
复旦大学（B）
厦门大学（B）
上海交通大学（B）
南京大学（B）
浙江大学（B）
建议：
北京大学、 清华大学和 中国科学技术大学在分子科学与工程专业方面具有极高的声誉，是顶尖的选择。
南开大学和 天津大学在该专业排名中也非常靠前，具有很好的教学和研究实力。
其他如 复旦大学、 厦门大学、 上海交通大学、 南京大学和 浙江大学也是不错的选择，具体选择可以根据个人兴趣和职业规划来决定。