南京医科大学的长学制通常指的是临床医学专业的五年制或长学制（如天元班）。长学制学生通常在临床实习方面有特殊的要求，例如：
临床医学专业五年制（全科医学专业）临床实习；
临床医学专业长学制临床通科实习阶段，包括内科、外科、妇产科、儿科等实习大纲规定的理论内容及需要掌握的临床实践技能。
此外，长学制学生在转专业方面可能有特殊的规定，例如：
长学制（天元班）转专业另行规定，不纳入选拔类转专业范畴；
本轮转专业选拔工作仅面向非临床医学类专业学生，接收专业仅为临床医学（五年制）专业。
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