大学二本C和三本之间的区别主要体现在以下几个方面：
学科要求
二本C类：更注重基础学科的学习，尤其是与专业相关的数学、物理、计算机等方面的知识。
三本：相对注重实践能力和专业技能的培养，对基础学科的要求较为宽松。
研究生录取
二本C类：学生相对于三本更容易被研究生院录取，因为他们在基础学科方面有更为扎实的基础。
三本：学生如果想读研究生，一般需要通过考研或者其他途径提高自己的竞争力。
学校水平
二本C类：学校的整体实力相对较强，包括师资力量、科研水平、实验设备等方面更为优秀。
三本：学校整体实力相对较弱一些。
学费和就业
二本C类：学费通常比三本高，因为学校的整体水平更高。同时，二本C类的学生在就业方面更有竞争力，毕业后找工作的机会更多一些。
三本：学费通常较低，但就业时可能会受到一定程度的区别对待，民办大学毕业生相对于公办大学毕业生可能会遭到小程度的歧视。
招生对象和录取时间
三本：招生对象是参加普通高等学校招生全国统一考试的普通高等教育本科考生，录取时间通常在7月份。
二本C类：招生对象是参加普通高等学校招生全国统一考试的普通高等教育专科考生，录取时间通常在8月份。
办学性质
二本C类：大多是公办省属院校。
三本：基本是独立学院（公办民助）和民办本科，合并批次不会改变办学实质，就业时行业对考生还是有区分方法和标准的。
毕业证含金量
二本C类：虽然名称有所改变，但毕业证上依旧是独立院校的公章，招聘单位负责人一眼就能分辨出来，实际上没有实质区别。
三本：毕业证上也会注明是独立学院，但就业时可能会受到一定程度的区别对待。
总的来说，二本C类和三本在学科要求、研究生录取、学校水平、学费和就业、招生对象和录取时间、办学性质以及毕业证含金量等方面都存在明显的差异。二本C类更注重基础学科的学习和学术能力，而三本则更侧重于实践能力和专业技能的培养。此外，二本C类学校的整体实力较强，就业竞争力也相对较高。