南京航空航天大学（南航）的专业院系设置如下：
航空宇航学院：
主要研究航空器的设计、制造、测试与飞行控制等方面的技术。涵盖的专业包括飞行器设计、飞行器制造工程等。
计算机科学与技术系：
专注于计算机科学和技术的教育和研究，涉及计算机软件开发、网络工程、信息安全等专业。
电子信息工程系：
涵盖了通信工程、电子信息工程等专业，主要研究信息的传输和处理技术。
能源与动力学院：
研究飞行器动力工程、能源与动力工程、车辆工程等专业。
自动化学院：
包括自动化、电气工程及其自动化、测控技术与仪器、生物医学工程、探测制导与控制技术等专业。
电子信息工程学院：
涉及电子信息类、微电子科学与工程等专业。
机电学院：
专业包括机械工程、工业设计、飞行器制造工程、机器人工程。
材料科学与技术学院：
涵盖材料科学与工程、应用化学、核工程类、新能源材料与器件等专业。
民航学院/飞行学院：
专业包括交通运输（空中交通管制与签派）、交通运输（民航运输管理）、交通运输（民航机务工程）、交通运输（民航电子电气工程）、交通运输（机场运行与管理）、土木工程、飞行器适航技术、飞行技术等。
物理学院：
专业包括信息与计算科学、应用物理学、应用统计学。
经济与管理学院：
涵盖管理科学与工程类、经济与贸易类、工商管理类。
人文与社会科学学院：
包括法学、政治学与行政学、公共事业管理。
艺术学院：
专业有广播电视学、音乐表演、戏剧影视美术设计、环境设计。
外国语学院：
提供英语（民航业务、国际贸易）、日语等专业。
航天学院：
专业包括飞行器控制与信息工程、航空航天工程、光电信息科学与工程。
人工智能学院：
涉及计算机科学与技术、信息安全、软件工程、物联网工程、人工智能。
国际教育学院：
提供自动化（航空电子与控制）（中外合作办学）、交通运输（机场运行与管理）（中外合作办学）。
马克思主义学院：
负责马克思主义学院的相关专业。
长空学院：
负责长空学院的相关专业。
通用航空与飞行学院：
专业包括飞行技术、交通运输（民航机务工程）。
继续教育学院：
提供高等职业技术教育。
这些院系涵盖了航空航天、信息科学、工程技术、经济管理、人文社科等多个领域，形成了较为全面的学科专业体系。建议根据个人兴趣和职业规划，选择适合的学院和专业进行深入学习。