三本和职业大学的主要区别体现在以下几个方面：
学历层次
三本院校：属于本科层次，本科学历对考生今后的深造和发展比较有利，三本院校的合格毕业生能直接考研，招录公务员时大部分单位也要求具有本科及以上学历。
职业大学：属于专科层次，注重学生实践能力的培养，更看重将来的就业，学生经过在校培养可具备直接适应岗位工作的能力。
办学性质
三本院校：通常是独立学院或民办本科高校，依托母体院校的支持，办学时间一般较短，但一些独立学院已逐步形成自己的办学特点。
职业大学：承担学历性职业教育任务，分为初等职业学校、中等职业学校和高等职业学校，与一些行业有密切的关系，专业优势明显。
收费情况
三本院校：收费普遍较高，一年学费可能相当于一般高职三年的学费。
职业大学：收费较低，更符合一般家庭的经济承受能力。
社会认可度
三本院校：虽然属于本科，但由于社会对三本院校的认可度相对较低，可能会受到一定程度的歧视。
职业大学：虽然社会认可度逐渐提高，但仍有部分家长和学生对其存在偏见。
教学内容和培养目标
三本院校：注重理论知识的传授和学习，教学目标更偏向研究型。
职业大学：偏重实用性知识的讲解和技能的培养，教学目标更偏向应用型。
未来发展
三本院校：毕业生具备本科学历，有资格直接考研和参加公务员招录。
职业大学：毕业生具备专科学历，虽然可以直接就业，但若有意向继续深造，可以选择专升本，获取本科学历。
建议
三本院校：适合追求更高学历和更好学术氛围的学生，尽管社会认可度较低，但本科学历仍具有明显优势。
职业大学：适合注重实践技能和就业能力的考生，学费较低，且可以通过专升本继续深造获取本科学历。
考生应根据自身兴趣、职业规划及经济条件，综合考虑选择三本院校还是职业大学。