超二本线40分的大学包括以下几所：
1. 中国民用航空飞行学院，理科投档最低分为499分，超二本线40分。
2. 吉首大学，理科投档最低分为469分，超二本线40分。
3. 深圳职业技术大学，理科投档最低分为463分，超二本线40分。
4. 成都航空职业技术学院，文科投档最低分为478分，超二本线21分。
5. 四川电力职业技术学院，文科投档最低分为475分，超二本线18分。
6. 黑龙江八一农垦大学，文科超二本线40分能上的大学之一。
7. 齐鲁理工学院，文科超二本线40分能上的大学之一。
8. 哈尔滨商业大学，文科超二本线40分能上的大学之一。
9. 河北水利电力学院，多个省份本科招生最低分数在四百多分，超出二本线二十分左右。
10. 天水师范学院，师范类院校，超二本线40分能上的大学之一。
建议根据具体专业偏好、地理位置等因素，综合考虑这些院校。