三本大学里确实有二本专业。虽然三本大学主要是民办大学，但有些三本大学在某个时期或某些专业上会有二本专业的招生。以下是一些具体的例子：
南京大学金陵学院：
南京大学金陵学院在2015年由三本招生成功升级为二本批次的招生，但仅在江苏省进行二本批次的招生，在省外还是三本院校。
东南大学成贤学院：
南京理工大学紫金学院、南京航空航天大学金城学院和东南大学成贤学院也是由三本招生成功升级为二本批次的院校，但同样仅在江苏省进行二本批次的招生。
四川师范大学的安全工程专业：
四川的所有二本院校中，只有四川师范大学的安全工程专业是三本，且只招收理工科考生。进入大学后，如果考的是二本专业，可以在二本专业之间转专业，但艺术类专业不得转入非艺术类专业。
贵州民族大学：
贵州民族大学没有一本专业，主要以二本专业为主。
需要注意的是，随着教育改革的深入，一些省份已经取消了三本和二本的界限，统一进行本科“新二批”录取。因此，未来的趋势可能是不再区分一本、二本和三本，而是统一称为本科批次。在这种情况下，三本大学里的二本专业可能会逐渐减少或消失。
综上所述，虽然三本大学里确实有二本专业，但随着教育改革的推进，这种区分可能会逐渐淡化。建议关注所在省份的最新高考政策，以获取最准确的信息。