截至2024年，南京最好的大学排名如下：
南京大学
全国排名第6
985工程、211工程、双一流世界一流大学A类建设高校
东南大学
全国排名第12
985工程、211工程、双一流世界一流大学A类建设高校
南京农业大学
全国排名第38
211工程、985平台建设高校
南京理工大学
全国排名第52
211工程、985工程
南京航空航天大学
全国排名第50
211工程、985工程
南京师范大学
全国排名第62
211工程
南京工业大学
全国排名第83
211工程
中国药科大学
全国排名未详细列出
211工程
南京邮电大学
全国排名未详细列出
211工程
南京中医药大学
全国排名未详细列出
211工程
南京林业大学
全国排名第72
211工程
建议：
南京大学在全国的排名较高，是江苏省乃至全国都非常重视的高等学府。
东南大学虽然在全国的排名略低，但在江苏地区的知名度和影响力非常大。
南京农业大学、南京理工大学和南京航空航天大学在各自的领域内有很高的声誉，尤其是农林类和航空航天类专业。
这些排名综合了不同年份和不同来源的数据，建议参考多个排名来获得更全面的了解。