东莞市的公办二本大学包括：
东莞理工学院：
位于广东省东莞市，是一所省市共建的本科院校，以理工科为主，拥有材料科学、工程科学、化学、电子信息工程等优势专业。
广东海洋大学：
位于广东省湛江市，是一所以海洋科学为特色的综合性大学，拥有较为广泛的学科设置。
广东技术师范大学：
位于广东省广州市，是一所公办省属师范大学。
广东药科大学：
位于广东省，是一所医药类公办大学。
惠州学院：
位于广东省惠州市，是一所综合性公办大学。
广东金融学院：
位于广东省，是一所财经类公办大学。
广东医科大学：
位于广东省，是一所医药类公办大学。
建议：
东莞理工学院作为东莞市唯一的公办本科院校，在本地及广东省内都有一定的知名度，其多个专业在二本批次招生，建议优先考虑。
广东海洋大学和 广东技术师范大学等大学在特定领域有较强实力，可以根据个人兴趣和职业规划进行选择。