民办大学辍学后，档案的存放位置主要取决于学生是否已经办理完相关手续以及档案的转移情况。以下是几种可能的存放地点：
学校学籍科或相应管理单位
如果学生直接自行退学，没有与学校方面协商和办理相关手续，那么档案会一直存放在学校教务处的学籍科。
如果学生已经办理完相关手续，档案可能会被邮寄回生源地的民政局或人才中心。
户口原籍地人才中心
根据《普通高等学校学生管理规定》，退学学生的档案原则上会被退回学生家庭所在地的人才中心。
档案在寄送过程中，如果学校人员遗忘转档案的事，档案可能会滞留在学校，也可能造成遗失。
街道办事处或就业人事服务局
档案有时也会发还学生所在的街道办事处或者就业人事服务局，需要学生申请调函去学校档案室办理，然后档案会被送回这些机构。
建议
及时联系学校：如果档案还留在学校，应尽快联系学校的学籍科或学生处，了解具体的存档位置和取回档案的流程。
办理转移手续：如果档案已经邮寄回原籍地，应尽快办理档案转移手续，确保档案能够顺利到达户籍地人才中心。
保管档案：不建议个人长期保管档案，因为档案长期在自己手里超过2年就会变成死档，超过35岁则无法再激活。
通过以上信息，可以更清楚地了解民办大学辍学后档案的存放位置和转移流程，以便及时、准确地处理档案事宜。