民办大学如果未依照相关条例进行备案，将会面临以下后果：
国家不承认学历 ：民办高校的办学若未在教育部备案，则其学历国家不承认。
行政处罚
民办学校若未将出资人取得回报比例的决定和与其办学水平和教育质量有关的材料、财务状况报审批机关备案，或备案材料不真实，将被责令改正并给予警告；有违法所得的，没收违法所得；情节严重的，责令停止招生、吊销办学许可证。
发布未经备案的招生简章和广告的民办高校，可受到1万元至3万元罚款、减少招生计划或暂停招生的处罚。
招生和学历认证问题
未经备案的民办大学毕业生学历无法在学信网上查到。
计划外招生的学生拿到的毕业证属于民办类毕业证，也只能在学校官网或民教网上查到，不能在学信网上查询。
综上所述，民办大学必须依法进行备案，否则将面临严重的法律后果和招生限制，同时其毕业生的学历认可度也会受到影响。因此，建议学生在报考民办大学时，务必查询学校是否已经完成备案。