三本和普通大学（一本、二本）在多个方面存在区别，主要包括以下几个方面：
录取批次
一本（包括重本、普本）为第一批次录取。
普通二本为第二批次录取。
普通三本为第三批次录取。
办学层次和性质
一本、二本、三本都属于本科教育层次，没有高低之分，只是侧重不同。
重点本科高校（985、211高校）重理论研究，普通本科高校（普通一本、二本、三本高校）重理论应用。
学费
一本、二本的学费相对较低，三本院校的学费相对较高。
毕业证书和学位证书
一本、二本、三本高校颁发的都是普通本科学历证书和学士学位证书，证书上均不标明是几本，只表明是本科，并且证书上加盖的是各高校的印章。
招生标准和学科设置
一本大学通常拥有更多的重点学科和研究机构，注重理论研究。
三本大学则更加注重应用型学科和职业技术教育，学科设置更侧重于实际应用。
社会认可度
虽然三本院校的毕业证书和学位证书在形式上与一本、二本相同，但在社会认可度上可能存在一定差异。一本、二本院校由于历史悠久和学术声誉较高，通常更受用人单位和社会的青睐。
教学资源和校园独立
三本院校通常具有“校园独立、招生独立、财务独立”等特点，虽然部分师资力量与教学设施可能与校本部共享，但整体上教学资源相对较弱。
建议
选择院校：考生在选择三本院校时，应综合考虑自身的学术兴趣、职业规划以及家庭经济情况。虽然三本院校的学费较高，但它们也提供了应用型学科和职业技能培训，适合那些希望直接就业或创业的学生。
学术发展：对于希望继续深造的学生，一本、二本院校在研究生考试和学术发展方面可能更具优势，因此这些学生应优先考虑这些高校。
总之，三本和普通大学在多个方面存在区别，但它们都属于本科教育层次，毕业生均能获得普通本科学历证书和学士学位。考生在选择院校时，应根据自身需求和目标进行综合考虑。