民办大学主要需要缴纳的税种包括以下几种：
企业所得税
盈利的民办大学需要缴纳企业所得税，一般税率为25%，但符合条件的非营利教育机构可以享受15%的优惠税率。
增值税
从2025年1月1日起，民办大学提供的教育服务和职业培训服务将按20%的标准税率征税。
2024年7月29日之后开具或支付的学费，如果涉及2025年1月1日之后的学期，也将按20%的标准税率征税。
高校通过教育服务活动获取的费用可以享受免征增值税的优惠政策，但其他渠道获得的社会投资、赞助费用等需要缴纳增值税。
印花税
民办大学在进行合同、账簿、证照、票据等经济活动时，需要缴纳印花税，具体税率根据印花税的具体项目而定，一般为0.005%-0.1%。
房产税
民办大学如果拥有自己的校舍，需要缴纳房产税，税率一般为1.2%，但用于教学的校舍可以享受免税或减税的优惠政策。
土地使用税
民办大学如果使用的土地是自己购买的，需要缴纳土地使用税，具体税率根据土地的位置和用途而定，一般为每年每平方米1-30元。
城市维护建设税和教育费附加
这两种税是附加在其他税种上的，税率一般为7%和3%。
个人所得税
学校聘用的基层教职员工及中层管理人员按规定支付的工资、津贴及其他财产性报酬达到法定标准的，需要由学校扣缴个人所得税。
资源税
民办大学还需要缴纳资源税，税率根据地区不同而不同，一般较低。
地方教育附加税
民办大学需要缴纳地方教育附加税，具体税率由国家税务总局规定。
契税
在特定情况下，如购买固定资产或进行其他大额交易时，民办学校可能需要缴纳契税。
建议：
民办大学应当仔细研究相关税收政策，确保合法合规经营，并充分利用税收优惠政策以减轻税负。同时，与税务机关保持良好沟通，及时了解和适应税收政策的变化。