安徽民办大学硕士排名中，安徽新华学院和安徽信息工程学院位列前两名。具体排名如下：
安徽新华学院
排名：全国民办大学第24名
简介：安徽新华学院位于安徽省合肥市，创办于2000年，2019年获批为安徽省新增硕士学位授权立项建设单位。截至2023年，学校开设有62个本科专业，其中电子信息工程为省级一流专业，通信工程、计算机科学与技术、土木工程、电子信息工程、动画5个专业为省级特色专业。
安徽信息工程学院
排名：全国民办大学第21名
简介：安徽信息工程学院位于安徽省芜湖市，其前身为创办于2003年的安徽工程科技学院机电学院，2016年转设并更名为安徽信息工程学院。其软件工程、机械设计制造及其自动化、通信工程、计算机科学与技术、产品设计等专业是学校的优势专业。
建议：
安徽新华学院和安徽信息工程学院在安徽省乃至全国民办大学中均具有较高的综合实力，尤其是安徽信息工程学院在全国的排名较高，建议优先考虑这两所学校。
其他如皖江工学院、合肥城市学院等也是安徽省内较为知名的民办高校，可以根据个人兴趣和专业需求进一步了解。