日本的大学可以分为国立、公立和私立三种。
国立大学
由日本国家政府直接设置，由国家全额出资建立。
例如：东京大学、京都大学、大阪大学等。
国立大学的专业设置倾向于研究性，以科研成果为宗旨。
国立大学的数量约为86所，每个县至少有一所。
公立大学
由日本地方政府设立，目标是培养地方经济和文化发展所需的人才。
主要经费来源是政府财政拨款，学费收入占比较小。
例如：东京都立大学、大阪市立大学、名古屋市立大学等。
公立大学的数量约为98所，专业设置较倾向于学术性，与当地联系紧密，毕业后在当地找工作有优势。
私立大学
由民间资本创建运营，依靠学生的学费、捐款、募款等非政府资金维持经营。
例如：早稻田大学、庆应义塾大学、同志社大学等。
私立大学的专业设置通常倾向于就业率，学校硬件设备较新，政策转换灵活，与市场结合紧密。
私立大学的数量最多，约占日本大学总数的三分之二。
学费差异
国立大学：学费较低，学部生每年学费约为53.58万日元（约合人民币2.5万元），大学院生每年学费约为53.58万日元（约合人民币2.5万元）。
公立大学：学费较国立大学稍高，但总体较为统一，文科每年约80~100万日元（约合人民币3.7万~4.6万元），理科每年约100~130万日元（约合人民币4.6万~6.5万元），医科每年约200~400万日元（约合人民币9万~18万元）。
私立大学：学费较高，没有统一标准，文科每年约80~100万日元（约合人民币3.7万~4.6万元），理科每年约100~130万日元（约合人民币4.6万~6.5万元），医科每年约200~400万日元（约合人民币9万~18万元）。
入学形式
国立大学：注重学生的全面发展，对各科成绩和研究能力要求较高，通常设有研究生制度。
公立大学：入学考核形式较为统一，一般要求提交EJU考试成绩，部分学校还会进行校内考。
私立大学：入学考核形式较为自由多样化，部分学校要求提交EJU考试成绩，有些学校只需参加校内考或直接面试。
建议
经济条件有限的学生：建议选择国立大学或公立大学，学费较低，有政府的经费支持。
追求学术研究的同学：国立大学的专业设置和研究水平较高，是理想的选择。
重视就业和实用性：私立大学的专业设置更倾向于就业率，且硬件设备较新，政策灵活，适合这部分学生。