在北碚区的三本大学中，至少包括以下几所：
西南大学 校训：
含弘光大，继往开来
地址：重庆市北碚区天生路2号
特点：教育部直属，教育部、农业农村部、重庆市共建的重点综合大学，国家首批“世界一流学科建设高校”，国家"211工程"和"985工程优势学科创新平台"建设高校，"双一流"农科联盟成员高校。1936年更名为四川省立教育学院。
重庆师范大学 地址：
重庆市北碚区
特点：重庆市与教育部“省部共建”高校，重庆市与教育部“三特行动计划”特色高校。
重庆青年职业技术学院 地址：
重庆市北碚区
特点：以培养青年人才为主的高等职业技术学院。
综上所述，北碚区至少有三所三本大学，分别是西南大学、重庆师范大学和重庆青年职业技术学院。