私立三本大学合并二本后，其性质和名称并不会发生改变。具体来说，有以下几点需要注意：
高校性质不变
合并后，原来的民办三本大学并不会变成公办二本大学，依然是民办学校。
招生批次合并
合并的是录取批次，而不是学校本身。三本院校会并入二本批次进行招生，这样所有学校都处于同一招生层次。
毕业证不变
合并后，无论是二本还是三本，其毕业证上均会注明“本科”字样，而不会区分二本或三本。
录取分数变化
合并后，由于三本院校并入二本批次，录取分数可能会根据学校的实力有所调整。民办二本（原三本）的录取分数可能会高于公办二本。
考生选择难度增加
合并后，考生可选择的学校数量增加，但同时也面临更大的选择难度。往年的分数线可能失去参考价值，考生在填报志愿时需要更加谨慎。
社会观念影响
合并有助于消除对三本民办大学的偏见，统称为本科专业，有助于减少社会上的歧视。
总的来说，私立三本大学合并二本后，虽然学校的招生层次提高了，但学校的性质、毕业证以及收费标准并未发生改变。考生在填报志愿时需要更加关注学校的实力和自身的分数，以做出更为合适的选择。