全国开设水利水电工程专业三本院校共 16所，具体如下：
1. 兰州交通大学博文学院
2. 太原理工大学现代科技学院
3. 河北工程大学科信学院
4. 昆明理工大学津桥学院
5. 贵州大学明德学院
6. 青海大学昆仑学院
7. 天津大学仁爱学院
8. 湖南农业大学东方科技学院
9. 三峡大学科技学院
10. 兰州理工大学技术工程学院
11. 新疆农业大学科学技术学院
12. 河北农业大学现代科技学院
13. 长沙理工大学城南学院
14. 成都理工大学工程技术学院
15. 扬州大学广陵学院
16. 河海大学文天学院
建议选择这些学校时，可以综合考虑学校的师资力量、教学设施、实习机会以及就业前景等因素。