民办大学在发展过程中遇到的主要问题包括：
生源减少：
随着人口结构的变化，适龄生源总量下降，民办高校面临招生难题。公办高校凭借其深厚的底蕴和资源吸引了大量优质生源，而民办高校只能在剩余生源中艰难选择，甚至面临招不满的尴尬局面。
学费过高：
民办高校的学费相对较高，对于许多家庭来说是一笔不小的经济负担，导致不少学生望而却步。
教学质量参差不齐：
部分民办高校办学理念不清晰，专业设置缺乏特色与前瞻性，课程体系陈旧，难以适应社会需求和就业市场变化。师资队伍建设薄弱，优秀教师留不住，教学质量难以得到有效保障。
毕业生就业问题：
一些民办高校的毕业生就业率较低，影响学校声誉和生源质量。
管理不科学：
民办高校在教学管理、财务管理等方面存在不科学之处，影响了学校的整体运营和发展。
产权不明晰：
产权问题一直是困扰民办高等学校发展的一个严重问题，产权涉及内容较多和产权主体的复杂性，使得民办高校在处理自身产权的过程存在一些问题。
资金短缺：
由于招生困难、学费收入减少等原因，民办高校普遍面临资金短缺的问题，影响了学校的正常运营和发展。
监管不严：
一些民办高校因为监管不严，导致债务危机频发，影响了学校的稳定性和发展。
招生宣传不足：
相比于公办高校，民办高校在招生宣传方面可能存在不足，导致许多优秀的学生可能不知道民办高校的存在，从而错失了报考的机会。
社会观念的影响：
社会对民办高校的认可度相对较低，影响了学生的报考意愿。
综上所述，民办大学在发展过程中需要解决生源减少、学费过高、教学质量参差不齐、毕业生就业难、管理不科学、产权不明晰、资金短缺、监管不严、招生宣传不足以及社会观念影响等多方面的问题，以提升自身的竞争力和可持续发展能力。