同济大学本身是一所一本院校，即一类本科学校。然而， 同济大学确实有三本学校，这些学校是同济大学与合作伙伴共同举办的独立学院，它们在招生时属于第三批次。以下是一些具体的学院：
同济大学萧山学院：
该学院成立于2008年，是国家教育部正式批准的独立学院，属于三本大学。
同济大学浙江学院：
该学院同样成立于2008年，由同济大学与宏达控股集团有限公司和嘉兴市教育发展投资有限责任公司合作举办，也是三本大学。
同济大学中德工程学院：
虽然该学院不是传统意义上的三本学院，但它在国内3年德国1年的教学模式使其在招生时有一定的特殊要求，通常被认为是接近一本的学院。
综上所述，同济大学确实有三本学校，分别是同济大学萧山学院、同济大学浙江学院和同济大学中德工程学院。这些学院虽然与同济大学合作举办，但在招生时独立进行，属于不同的批次。建议学生在选择学院时，可以综合考虑自身的学术目标和职业规划，选择最适合自己的学院。