大学一本、二本、三本的差别主要体现在以下几个方面：
办学层次
一本高校通常是重点大学，包括985和211工程高校，侧重于理论研究。
二本高校是普通公办本科院校。
三本高校主要是民办本科院校，包括独立学院和民办本科院校。
性质
一本高校主要是公办高校。
二本高校大多是公办高校，但也有少数是民办高校。
三本高校主要是民办高校，包括独立学院等。
学费
一本高校的学费相对较低。
二本高校的学费也相对较低，但有些转设二本的学费可能较高。
三本高校的学费相对较高。
招生批次
一本高校在高考招生中属于第一批次录取。
二本高校在高考招生中属于第二批次录取。
三本高校在高考招生中属于第三批次录取。
教育重点
一本高校重理论研究，培养高层次人才。
二本高校重理论实践应用，培养应用型人才。
三本高校注重应用型学科和职业技术教育。
毕业证书和学位证书
一本、二本、三本高校的毕业证书和学位证书都是相同的，都是普通本科学历，不存在高低之分。
总的来说，一本、二本、三本高校在办学层次、性质、学费、招生批次、教育重点和毕业证书等方面存在明显的差别，但它们都属于“普通高等学校”教育系列，毕业生都将获得国家和社会承认的相同水平的学历证书。建议学生在选择高校时，可以根据自己的兴趣、职业规划及家庭经济情况，综合考虑这些因素。