南京大学作为中国的顶级学府，其整体实力、师资力量、教学设施、学术声誉等方面都远超一般的三本院校。以下是一些具体的比较：
办学层次
南京大学：985高校，拥有深厚的学术积淀和丰富的教育资源，属于国内一流大学。
南京大学金陵学院：虽然是南京大学的三本附属院校，但其教学资源和学术氛围继承了南京大学，录取分数也较高，在同类三本院校中表现优秀。
师资力量
南京大学：拥有众多知名教授和学者，师资力量雄厚。
南京大学金陵学院：虽然是一所三本院校，但其师资力量在一定程度上超越了其他三本院校，能够为学生提供优质的教育。
教学设施
南京大学：拥有先进的实验室、图书馆、体育设施等，为学生提供了良好的学习环境。
南京大学金陵学院：虽然设施相对较新，但也继承了南京大学的优质教学资源，能够满足学生的学习需求。
学术声誉
南京大学：在国内乃至国际上都享有极高的声誉，是众多学子梦寐以求的高等学府。
南京大学金陵学院：虽然作为三本院校，但在某些排名中表现优异，得到了社会的认可。
专业设置
南京大学：设有多个学科门类，包括人文学科、社会科学、理学、工学、医学等，专业设置齐全。
南京大学金陵学院：以文科和理工科为主，继承和发展了南京大学的优势专业，培养了一批优秀的毕业生。
就业前景
南京大学：毕业生在就业市场上具有极高的竞争力，许多毕业生进入国内外知名企业、研究机构、高校等。
南京大学金陵学院：毕业生在就业市场上也表现出色，尤其是在财经、审计等领域。
建议
对于高考生：如果分数允许，建议优先考虑南京大学本校，以获得更好的教育资源和学术氛围。如果分数略低，可以考虑南京大学金陵学院或其他优秀的三本院校，如东南大学成贤学院、南京理工大学紫金学院等。
对于在读学生：无论在哪所院校，都应充分利用学校提供的资源，努力学习，提升自己的综合素质和竞争力，为未来的职业发展打下坚实基础。
总之，南京大学及其附属的三本院校在多个方面都具有明显的优势，是江苏地区乃至全国范围内值得考虑的高等教育机构。