三本大学的单位性质主要是 民办或企业。三本院校，即本科三批高校，通常是由国家教育部严格审批和监管的正规教育机构。它们在招生、学籍管理等方面遵循国家统一规定，拥有固定的校舍和专业的导师团队，实行全日制授课制度，为毕业生提供全面的教育服务。
从性质上来看，三本大学不属于事业单位，因为事业单位是指由国家设立的公共服务机构，主要承担教育和科研任务，并且其性质决定了其工作的公共性和非营利性。而三本大学则是由非国家财政支持的社会组织或个人创办的，它们以盈利为目的，收入主要来源于学生的学费。
此外，虽然有些三本大学可能是独立学院，这些学院在形式上属于公有，但因为完全由民间投资运营，所以在性质上仍被视为民办独立学院。
综上所述，三本大学的单位性质主要是民办或企业，它们自负盈亏，主要依靠学生的学费收入来维持运营。