日本著名医学院包括以下几所：
京都大学医学部：
京都大学是一所本部位于日本京都市左京区的国立研究型大学，其医学部在医学教育和研究方面享有极高的声誉。京都大学医学部与东京大学医学部并列为日本顶尖的医学院，两校之间存在竞争关系。
东京大学医学部：
东京大学成立于1877年，是日本的一所国立大学，也是亚洲创办最早的大学之一。东京大学医学部以其高门槛和淘汰率著称，但在专业水平方面享有亚洲大学第一的地位。该学院的大多数课程以临床医学为基础，能够有效地培养学生的临床技能。
东京医科齿科大学医学部：
东京医科齿科大学位于日本东京都文京区，是日本著名的国立大学。该大学在牙科医学方面尤为著名，综合实力毋庸置疑。
东北大学医学部：
东北大学是一所位于宫城县仙台市的日本国立大学。医学部在国立大学的医学部中，实力也是前列，以研究第一为目的，设立的高端研究教学设施，聘请高级顶端医学教员，是各国留学生求医学习的首选。
九州大学医学部：
九州大学医学院成立于1903年，下设医学系、健康科学系和生物医学系。该大学在医学教育和研究方面具有很高的水平，医学部在世界知名度非常高。
庆应义塾大学医学部：
庆应义塾大学医学部创建于1917年，是私立大学中的最好名校之一。该部已培养出7,000余名毕业生，在医学教育、研究、医疗保健、医务行政等方面均做出了很大贡献。
大阪大学医学部：
大阪大学成立于1931年，是一所本部位于日本大阪府吹田市的顶尖综合研究型国立大学。大阪大学医学部作为日本七所帝国大学之一，常年稳居全国前三的位置。
奈良医科大学医学部：
奈良医科大学成立于1945年，位于奈良县橿原市，以开展MBT（Medicine-based Town）为特色。该机构希望学生利用自己所拥有的专业技能为社会做出贡献。
这些医学院在日本乃至全球都享有很高的声誉，吸引了众多国内外优秀学生和学者。建议根据个人兴趣、学术目标和财务状况等因素，选择最适合自己的医学院进行报考。