波恩市设有几所著名的应用科技大学，以下是其中几所：
波恩-莱茵-锡格应用技术大学 （Bonn-Rhein-Sieg University of Applied Sciences, H-BRS）
性质： 公办
简介：成立于1995年，分为圣奥古斯丁校区和莱茵巴赫校区。圣奥古斯丁校区以理工学科为主，莱茵巴赫校区以经济管理为主，同时设有化工系和自然科学院。提供本科和硕士专业课程，包括企业经济学、计算机科学、电子技术、机械制造等。
波恩国际应用科学大学 （International University of Applied Sciences, Bad Honnef Bonn）
地址：Muehlheimer Strabe 38 D 53604 Bad Honnef
简介：位于巴德-鸿奈弗，是一所应用科学领域的教育机构。
波恩大学也是一所在波恩市内的著名大学，属于德国精英大学、U15大学联盟、Europaeum成员，提供包括基督教神学院、天主教神学院、法律经济学院、医学院、哲学院、数学自然科学学院、农学院和教育学院等多个学科的教育和研究。