南京的新能源专业大学中， 南京大学和南京工业大学都表现不错。
南京大学的新能源科学与工程专业非常优秀。该专业专注于风能、太阳能、地热、生物质能等新能源领域，旨在培养具有跨学科复合型高级工程技术人才和具有较强工程实践和创新能力的专门人才。南京大学的新能源专业是我国的急需人才，就业前景非常看好。
南京工业大学在新能源材料专业方面表现突出，该专业是学校的王牌学科之一。南京工业大学在高分子材料领域有多年积淀，并为行业输送了大量优秀人才。随着电动汽车的普及和国家对新能源产业的大力发展，新能源材料专业的研发成为热点，学习该专业未来潜力巨大。
此外，南京理工大学、华中科技大学等也是新能源专业较好的大学。
综合考虑，如果你对新能源科学与工程专业感兴趣，南京大学和南京工业大学都是非常好的选择。南京大学在新能源领域的研究和教学实力较强，而南京工业大学在新能源材料方面有着丰富的经验和良好的就业前景。