日本开设博士课程的大学包括但不限于以下几所：
东京大学（The University of Tokyo）
简称：东大
特色：综合性国立大学，日本最高学术殿堂。
博士课程学费：约2.6万元人民币/年。
京都大学（Kyoto University）
简称：京大
特色：综合性国立大学，日本仅次于东京大学。
博士课程学费：约2.7万元人民币/年。
东京工业大学（Tokyo Institute of Technology）
简称：东工大
特色：理工科大学，被誉为“亚洲的麻省理工学院”。
博士课程学费：具体金额未提及。
庆应义塾大学（Keio University）
简称：庆大
特色：日本著名私立大学，被誉为“企业家的摇篮”。
博士课程学费：约3.7万元人民币/年。
名古屋大学（Nagoya University）
特色：日本国立名古屋大学在亚洲发展较快的国家开设博士课程。
博士课程学费：具体金额未提及。
冲绳科学技术大学院大学（Okinawa Science and Technology University）
特色：提供5年全日制博士课程。
博士课程学费：具体金额未提及。
一桥大学（Hitotsubashi University）
特色：专注于人文社科研究的研究型大学。
博士课程学费：具体金额未提及。
立教大学（Ritsumeikan University）
特色：优质的私立大学，东京都内五大名门学府之一。
博士课程学费：具体金额未提及。
东洋大学（Toyo University）
特色：日本最早的哲学教育机关，设有外国哲学博士学位。
博士课程学费：具体金额未提及。
以上信息中，部分大学的博士课程学费和具体金额未提及，建议直接咨询相关大学获取最新信息。