日本拥有众多知名的大学，以下是一些著名的日本大学列表，按照学术声誉、研究实力等因素进行组织：
国际超一流大学
东京大学（Tokyo University）
京都大学（Kyoto University）
东北大学（Tohoku University）
大阪大学（Osaka University）
国际一流大学
九州大学（Kyushu University）
一桥大学（Hitotsubashi University）
名古屋大学（Nagoya University）
北海道大学（Hokkaido University）
庆应义塾大学（Keio University）
横浜市立大学（Yokohama City University）
东京工业大学（Tokyo Institute of Technology）
早稻田大学（Waseda University）
筑波大学（University of Tsukuba）
神户大学（Kobe University）
国内一流大学
千叶大学（Chiba University）
广岛大学（Hiroshima University）
御茶水女子大学（Ochanomizu University）
上智大学（Sophia University）
横滨国立大学（Yokohama National University）
东京理科大学（Tokyo University of Science and Technology）
首都大学东京（Tokyo Metropolitan University）
东京医科齿科大学（Tokyo Medical and Dental University）
国际基督教大学（International Christian University）
东京外国语大学（Tokyo Foreign Studies University）
地方的国公立大学
兵库县立大学（Kobe University of Economics, Business and Law）
福冈女子大学（Fukuoka Women's University）
爱知县立大学（Aichi University）
滋贺大学（Shiga University）
京都府立大学（Kyoto Prefectural University）
新潟大学（Niigata University）
名古屋市立大学（Nagoya City University）
大阪公立大学（Osaka City University）
北九州市立大学（Kitakyushu University）
日本的单科大学
日本大学（Nihon University）
以上列表涵盖了日本不同地区的顶尖高等教育机构，包括国立、公立以及私立大学。每所大学都有其独特的研究领域和特色，为学生提供了广泛的学习和职业发展机会。