南山区的顶尖大学排名如下：
南方科技大学
根据科睿唯安ESI排名，南方科技大学在2023年6月30日的统计中位列全国第62位。
在QS世界大学排名中，南方科技大学位列全球第150位（发布时间：2023-08-17）。
在泰晤士高等教育世界年轻大学排名中，南方科技大学位列世界第17位（发布时间：2023-07-03）。
在ABC中国大学排名中，南方科技大学位列公办排名前100，具体为第44名（发布时间：2024-05-16）。
深圳大学
根据科睿唯安ESI排名，深圳大学在2023年6月30日的统计中位列全国第36位。
在QS世界大学排名中，深圳大学位列全球第150位（发布时间：2023-08-17）。
在泰晤士高等教育世界年轻大学排名中，深圳大学位列世界第87位（发布时间：2023-07-03）。
在ABC中国大学排名中，深圳大学位列公办排名前100，具体为第56名（发布时间：2024-05-16）。
以上排名信息基于不同评价体系和统计时间，排名可能会随着时间和新的评价结果有所变动。如果您需要最新的排名信息，请参考相关教育机构发布的最新数据