基尔大学包含以下学院：
1. 神学院（Theologie）
2. 法学院（Rechtswissenschaften）
3. 经济—社会科学学院（Wirtschafts- und Sozialwissenschaften）
4. 医学院（Medizin）
5. 人文学院（Philosophie）
6. 数学—自然科学学院（Mathematik-Naturwissenschaft）
7. 农业学院（Agrarwissenschaften）
8. 技术学院（Technik）
9. 教育学院（Erziehungswissenschaften）
这些学院提供从本科到博士的多个专业课程，涵盖广泛的学科领域