神户大学的商科专业主要包括以下几个方向：
经济学
经济学部提供从基础理论到综合学习的课程，包括统计、分析、政策等方面。
主要课程有经济政策论、财政学、社会政策论、地方财政论、租税论、社会保障论等。
经营学
经营学专业综合学习企业经营和信息管理等相关知识。
主要学科包括经营、经营信息、会计等，具体课程有经营学总论、营销、经营统计论、经营管理论、生产管理论、人事劳务管理论、经营组织论、经营分析论、产业心理学等。
商学
商学专业允许学生从金融、贸易、流通等方向中选择一个进行专门学习。
其他相关专业
神户大学还提供如理论法学、政治学、实务法律、数学、物理学、化学、生物学、地球惑星科学、建筑学、市民工学、电气电子工学、机械工学、应用化学、系统科学、情报科学、计算科学、食料共生系统学、资源生命科学、生命机能科学等专业设置。
神户大学以其经营学尤为出名，被誉为“日本现代经营学研究的发祥地”，同时也是经济学和法学研究的重要基地之一