花都区内有多所大学，以下是部分大学的列表：
本科大学
广东第二师范学院（原名广东教育学院）
公办2A类本科高校
广东培正学院
民办本科高校
华南理工大学广州学院（原名汽车学院）
民办独立学院
大专院校
广东交通职业技术学院
3A类，公办比较热门的大专
广州大学市政技术学院
3A类，公办比较热门的大专
广东行政职业学院
3A类，公办大专院校
广州民航职业技术学院
3A类，公办大专院校，花都校区为新校区
广州铁路职业技术学院
3A类，公办大专院校，花都校区为新校区
广州大学纺织服装学院
3A类，公办大专院校，位于赤坭镇蓝田
广州工商职业技术学院
3B类，民办大专院校，位于狮岭海布
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