窦店地区拥有以下几所大学：
北京民族大学- 简称“北民大”，是一所全日制民办非学历高等教育机构，创建于1984年。
中国信息大学房山校区- 位于窦店镇，提供各类教育课程。
房山区良乡大学城- 包括北京工商大学、北京理工大学、首都师范大学、社科院研究生院等高等教育机构。
首都师范大学附属育新学校房山分校- 包括一所十二年一贯制学校和一所幼儿园，位于窦店高端制造业基地园区内。
北京理工大学管理学院国民经济动员中心- 与窦店镇沁园春景社区党支部开展党建共建活动。
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