日本拥有许多超级大学，以下是部分顶尖大学的列表：
东京大学（The University of Tokyo）
简称：东大 （Tōdai）
特色：日本最高学术殿堂，七所旧帝国大学之首，全球享有极高声誉。
京都大学（Kyoto University）
简称：京大 （Kyōto Daigaku）
特色：日本顶尖综合研究型国立大学，超级国际化大学计划A类顶尖校。
东北大学（Tohoku University）
特色：位于日本东北地方最大都市仙台市，以医学、农学、理学闻名。
大阪大学（Osaka University）
简称：阪大 （Osaka Daigaku）
特色：日本规模最大的国立大学之一，以语言专业著称。
早稻田大学（Waseda University）
简称：早大 （Waseda）
特色：日本历史悠久的综合学术机构，亚洲著名的私立学府。
庆应义塾大学（Keio University）
特色：日本人心目中排名最高的学府，文科和理工科实力平均。
名古屋大学（Nagoya University）
特色：日本顶尖的综合研究型国立大学，以工学和医学著称。
九州大学（Kyushu University）
特色：位于福冈市，是日本顶尖的综合性国立大学之一。
筑波大学（University of Tsukuba）
特色：以理工科研究著名，是日本超级国际化大学计划的A类顶尖校之一。
千叶大学（Chiba University）
特色：位于东京都市圈，拥有独特高水平学部学科的综合大学。
这些大学在日本乃至全球都享有极高的声誉，并在各自的领域有着显著的学术影响力。