燕京大学是由多个不同的基督教教会学校合并而成的，其前身包括以下三所教会学校：
汇文大学：
1889年由美国美以美会创办，初名崇内怀理书院，位于崇文门船板胡同（今汇文中学）。
华北协和女子大学：
1864年创办，初名贝满女塾，位于灯市口东口的佟府夹道胡同（后改办贝满女中）。
通州协和大学：
1867年创办，初名公理会潞河书院。
燕京大学在1916年创办，是中国近代史上规模最大、质量最好、环境最优美的大学之一，曾与哈佛大学合作成立哈佛—燕京学社，在国内外享有盛誉。
此外，燕京地区还有以下高等院校：
华北科技学院。
防灾科技学院。
交通运输部管理干部学院。
民政部管理干部学院。
北京经济职业技术学院。
中国防卫科技学院—文理学院（东校区）。
北京化工大学北方学院。
中央美术学院燕郊校区。
北京社会管理职业学院。
这些高校在各自的领域有着不同的特色和优势，共同构成了燕京地区丰富的高等教育资源。